The Experts below are selected from a list of 336 Experts worldwide ranked by ideXlab platform
Alfieri, Amauri Alcindo - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
-
Electrophoretic RNA genomic profiles of Brazilian Picobirnavirus (PBV) strains and molecular characterization of a PBV isolated from diarrheic calf
Published by Elsevier B.V., 2016Co-Authors: Takiuchi Elisabete, Macedo Rubia, Kunz, Andressa Fernanda, Gallego, Jessica Cristhine, Janaina Lustosa De ,mello, Otonel, Rodrigo Alejandro Arellano, Alfieri, Amauri AlcindoAbstract:AbstractPicobirnavirus (PBV) belongs to the family Picobirnaviridae. PBV are a group of emerging non-enveloped viruses, with a bisegmented double-stranded RNA genome that can infect a wide range of hosts. This study reports the occurrence of PBV in fecal samples from five Brazilian dairy cattle herds. From the 289 stool samples of individual calves analyzed by silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) the PBV was detected in 8.3 % (24/289), of which 10.2% (18/176) had diarrheic consistency. Of the 24 positive samples in ss-PAGE, 5 (20.8%) of them showed a small electrophoretic profile and 19 (79.2%) samples had large profile. From the 24 positives samples by ss-PAGE, 15 (62.5%) were successfully amplified (201bp) using GI specific primers targeting the RdRp gene of PBV. The analysis of nucleotide identity matrix revealed that the bovine PBV strain identified in this study, showed the highest nucleotide identity (81%) with PBV strain detected in turkey (MD-2010/HM803965). This is the first nucleotide sequence of a bovine PBV strain in the American continent and the first detection of small genome profile of PBV-like strains in bovine hosts
-
Vírus com genoma RNA fita-dupla segmentado em fezes de frangos de corte
Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2003Co-Authors: Tamehiro, Claudia Yurika, Alfieri, Alice Fernandes, Médici Cristina, Alfieri, Amauri AlcindoAbstract:Segmented double-stranded RNA (dsRNA) viruses were identified by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) technique in fecal samples from broiler chicken. A total of 378 fecal samples from 1-7 weeks old chickens were analyzed. dsRNA with migration profile characteristic of avian rotavirus (AvRV), reovirus (ARV) or Picobirnavirus (PBV) was identified in 32 (8.5%), 7 (1.8%) and 13 (3.4%) samples, respectively. AvRV and ARV occurred more frequently in chickens up to 1 month old and were related with enteritis signs. Considering only fecal samples of chickens with diarrhea, the AvRV was detected in 37.8% (14/37) and the ARV in 13.5% (5/37) of analyzed samples. AvRV was identified in only 1.5% (4/274) and ARV was not detected in normal feces collected from assymptomatic chickens (controls). PBV dsRNA was detected in broiler chickens from two to seven weeks old, more frequently in feces with pasty consistency. The AvRV showed great electrophoretic profile variability in the dsRNA segments and nine different electropherotypes were identified. Variation in genome pattern was not observed in either ARV or PBV.A técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida foi utilizada com o objetivo de identificar vírus com genoma contituído por RNA de fita dupla (dsRNA) segmentado, em material fecal de frangos de corte. Foram analisadas 378 amostras de fezes de aves, com idade entre a primeira e sétima semanas de vida, provenientes de granjas avícolas localizadas no Estado do Paraná, Brasil. dsRNA com perfil de migração característico de rotavírus (AvRV), reovírus (ARV) ou picobirnavírus (PBV), foi identificado em 32 (8,5%), 7 (1,8%) e 13 (3,4%) amostras, respectivamente. AvRV e ARV ocorreram com maior freqüência em aves com até um mês de idade e estiveram diretamente relacionados a fezes diarréicas e pastosas, provenientes de aves com sinais clínicos de enterite. Considerando-se apenas as amostras de fezes colhidas em aves com diarréia, o AvRV foi detectado em 37,8% (14/37) e o ARV em 13,5% (5/37) da amostragem analisada. Em fezes com aspectos normais (controle) obtidas de aves clinicamente sadias, o AvRV foi identificado em apenas 1,5% (4/274) e o ARV não foi detectado. O ácido nucléico do PBV foi detectado com maior freqüência em fezes pastosas colhidas de aves com duas a sete semanas de vida. O AvRV apresentou grande variabilidade eletroforética dos segmentos de dsRNA, tendo sido identificados nove eletroferotipos distintos. Não foram observadas variações no perfil genômico nas amostras de ARV e também de PBV
-
Segmented double-stranded genomic RNA viruses in fecal samples from broiler chicken
Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2003Co-Authors: Tamehiro, Claudia Yurika, Alfieri, Alice Fernandes, Alfieri, Amauri AlcindoAbstract:Segmented double-stranded RNA (dsRNA) viruses were identified by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) technique in fecal samples from broiler chicken. A total of 378 fecal samples from 1-7 weeks old chickens were analyzed. dsRNA with migration profile characteristic of avian rotavirus (AvRV), reovirus (ARV) or Picobirnavirus (PBV) was identified in 32 (8.5%), 7 (1.8%) and 13 (3.4%) samples, respectively. AvRV and ARV occurred more frequently in chickens up to 1 month old and were related with enteritis signs. Considering only fecal samples of chickens with diarrhea, the AvRV was detected in 37.8% (14/37) and the ARV in 13.5% (5/37) of analyzed samples. AvRV was identified in only 1.5% (4/274) and ARV was not detected in normal feces collected from assymptomatic chickens (controls). PBV dsRNA was detected in broiler chickens from two to seven weeks old, more frequently in feces with pasty consistency. The AvRV showed great electrophoretic profile variability in the dsRNA segments and nine different electropherotypes were identified. Variation in genome pattern was not observed in either ARV or PBV
-
Enteric virus with segmented double-stranded RNA genome in broiler chicken: Rotavirus, Reovirus and Picobirnavirus
UEL, 2000Co-Authors: Alfieri, Alice Fernandes, Tamehiro, Claudia Yurika, Alfieri, Amauri AlcindoAbstract:As infecções entéricas são responsáveis por consideráveis prejuízos econômicos à indústria avícola representados por perda de peso, baixa conversão alimentar, custos diretos e indiretos com tratamentos e por aumento na taxa de mortalidade. As patologias intestinais em aves, tanto com manifestação local quanto geral, podem ser determinadas por bactérias, protozoários e vírus, atuando de forma isolada ou em associação. Com relação a etiologia virai, vários gêneros têm sido isolados a partir de aves com enteropatias. Porém, dois gêneros na família Reoviridae, o rotavírus e o reovírus são encontrados com maior freqüência em fezes de frangos de corte e/ou galinhas poedeiras. Na maioria dos inquéritos epidemiológicos esses vírus estão associados a sinais clínicos de enterite. Esta revisão tem por objetivo apresentar alguns tópicos relativos aos agentes etiológicos (Rotavírus, Reovírus e Picobirnavírus), à doença clínica e aos métodos de diagnóstico, controle e profilaxia da infecção. Enteric infections account for considerable economic losses to the poultry industry through weight loss, low food conversion, direct and indirect expenses with treatments and increased death rates. Poultry intestinal pathologies, either with local or general manifestations, can be caused by bacteria, protozoa or virus, acting alone or in association. Regarding viral etiology, several genera have been isolated from poultry with enteric disease. However, two genera from the Reoviridae family, the rotavirus and the reovirus are found more frequently in broiler chicken and/or laying hen feces. These viruses have been associated with clinical signs of enteritis in most epidemiological research. This revision aims to present some topics on the etiological agents (rotavirus, reovirus and Picobirnavirus), the clinical disease and the diagnostic and control methods and prophylaxis of the infection.
-
Ocurrence of Escherichia Coli, rotavirus, Picobirnavirus and Cryptosporidium Parvum in a postweaning diarrhoea focus in swinw
UEL, 1994Co-Authors: Alfieri, Amauri Alcindo, Alfieri, Alice Fernandes, Julio Cesar De ,freitas, Caio Abercio Da ,silva, Freire, Roberta Lemos, Barros, Andrea Rodrigues, Barreiros, Marco Antonio Bacellar, Muller, Ernst EckehardtAbstract:No presente trabalho é descrita a etiologia de um foco de diarréia em leitões de creche em uma granja de ciclo completo. Os exames laboratoriais mostraram o envolvimento simultâneo de E. coli, rotavirus, picobirnavírus e Cryptosporidium parvum. Em-células VERO três amostras de E. coli produziram LT(toxina termolábil) e cinco VT (verotoxina). This work describes the etiology of a postweaning diarrhoea focus in a intensive piggery. The results of identification procedures showed the simultaneous occurrence of Escherichia coli, rotavirus, Picobirnavirus and Cryptosporidium parvum. In VERO cells culture, was detected the LT (termolabile toxin) production by three E. coli samples and VT (verotoxin) production by five samples
Alfieri, Alice Fernandes - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
-
Vírus com genoma RNA fita-dupla segmentado em fezes de frangos de corte
Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2003Co-Authors: Tamehiro, Claudia Yurika, Alfieri, Alice Fernandes, Médici Cristina, Alfieri, Amauri AlcindoAbstract:Segmented double-stranded RNA (dsRNA) viruses were identified by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) technique in fecal samples from broiler chicken. A total of 378 fecal samples from 1-7 weeks old chickens were analyzed. dsRNA with migration profile characteristic of avian rotavirus (AvRV), reovirus (ARV) or Picobirnavirus (PBV) was identified in 32 (8.5%), 7 (1.8%) and 13 (3.4%) samples, respectively. AvRV and ARV occurred more frequently in chickens up to 1 month old and were related with enteritis signs. Considering only fecal samples of chickens with diarrhea, the AvRV was detected in 37.8% (14/37) and the ARV in 13.5% (5/37) of analyzed samples. AvRV was identified in only 1.5% (4/274) and ARV was not detected in normal feces collected from assymptomatic chickens (controls). PBV dsRNA was detected in broiler chickens from two to seven weeks old, more frequently in feces with pasty consistency. The AvRV showed great electrophoretic profile variability in the dsRNA segments and nine different electropherotypes were identified. Variation in genome pattern was not observed in either ARV or PBV.A técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida foi utilizada com o objetivo de identificar vírus com genoma contituído por RNA de fita dupla (dsRNA) segmentado, em material fecal de frangos de corte. Foram analisadas 378 amostras de fezes de aves, com idade entre a primeira e sétima semanas de vida, provenientes de granjas avícolas localizadas no Estado do Paraná, Brasil. dsRNA com perfil de migração característico de rotavírus (AvRV), reovírus (ARV) ou picobirnavírus (PBV), foi identificado em 32 (8,5%), 7 (1,8%) e 13 (3,4%) amostras, respectivamente. AvRV e ARV ocorreram com maior freqüência em aves com até um mês de idade e estiveram diretamente relacionados a fezes diarréicas e pastosas, provenientes de aves com sinais clínicos de enterite. Considerando-se apenas as amostras de fezes colhidas em aves com diarréia, o AvRV foi detectado em 37,8% (14/37) e o ARV em 13,5% (5/37) da amostragem analisada. Em fezes com aspectos normais (controle) obtidas de aves clinicamente sadias, o AvRV foi identificado em apenas 1,5% (4/274) e o ARV não foi detectado. O ácido nucléico do PBV foi detectado com maior freqüência em fezes pastosas colhidas de aves com duas a sete semanas de vida. O AvRV apresentou grande variabilidade eletroforética dos segmentos de dsRNA, tendo sido identificados nove eletroferotipos distintos. Não foram observadas variações no perfil genômico nas amostras de ARV e também de PBV
-
Segmented double-stranded genomic RNA viruses in fecal samples from broiler chicken
Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2003Co-Authors: Tamehiro, Claudia Yurika, Alfieri, Alice Fernandes, Alfieri, Amauri AlcindoAbstract:Segmented double-stranded RNA (dsRNA) viruses were identified by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) technique in fecal samples from broiler chicken. A total of 378 fecal samples from 1-7 weeks old chickens were analyzed. dsRNA with migration profile characteristic of avian rotavirus (AvRV), reovirus (ARV) or Picobirnavirus (PBV) was identified in 32 (8.5%), 7 (1.8%) and 13 (3.4%) samples, respectively. AvRV and ARV occurred more frequently in chickens up to 1 month old and were related with enteritis signs. Considering only fecal samples of chickens with diarrhea, the AvRV was detected in 37.8% (14/37) and the ARV in 13.5% (5/37) of analyzed samples. AvRV was identified in only 1.5% (4/274) and ARV was not detected in normal feces collected from assymptomatic chickens (controls). PBV dsRNA was detected in broiler chickens from two to seven weeks old, more frequently in feces with pasty consistency. The AvRV showed great electrophoretic profile variability in the dsRNA segments and nine different electropherotypes were identified. Variation in genome pattern was not observed in either ARV or PBV
-
Enteric virus with segmented double-stranded RNA genome in broiler chicken: Rotavirus, Reovirus and Picobirnavirus
UEL, 2000Co-Authors: Alfieri, Alice Fernandes, Tamehiro, Claudia Yurika, Alfieri, Amauri AlcindoAbstract:As infecções entéricas são responsáveis por consideráveis prejuízos econômicos à indústria avícola representados por perda de peso, baixa conversão alimentar, custos diretos e indiretos com tratamentos e por aumento na taxa de mortalidade. As patologias intestinais em aves, tanto com manifestação local quanto geral, podem ser determinadas por bactérias, protozoários e vírus, atuando de forma isolada ou em associação. Com relação a etiologia virai, vários gêneros têm sido isolados a partir de aves com enteropatias. Porém, dois gêneros na família Reoviridae, o rotavírus e o reovírus são encontrados com maior freqüência em fezes de frangos de corte e/ou galinhas poedeiras. Na maioria dos inquéritos epidemiológicos esses vírus estão associados a sinais clínicos de enterite. Esta revisão tem por objetivo apresentar alguns tópicos relativos aos agentes etiológicos (Rotavírus, Reovírus e Picobirnavírus), à doença clínica e aos métodos de diagnóstico, controle e profilaxia da infecção. Enteric infections account for considerable economic losses to the poultry industry through weight loss, low food conversion, direct and indirect expenses with treatments and increased death rates. Poultry intestinal pathologies, either with local or general manifestations, can be caused by bacteria, protozoa or virus, acting alone or in association. Regarding viral etiology, several genera have been isolated from poultry with enteric disease. However, two genera from the Reoviridae family, the rotavirus and the reovirus are found more frequently in broiler chicken and/or laying hen feces. These viruses have been associated with clinical signs of enteritis in most epidemiological research. This revision aims to present some topics on the etiological agents (rotavirus, reovirus and Picobirnavirus), the clinical disease and the diagnostic and control methods and prophylaxis of the infection.
-
Ocurrence of Escherichia Coli, rotavirus, Picobirnavirus and Cryptosporidium Parvum in a postweaning diarrhoea focus in swinw
UEL, 1994Co-Authors: Alfieri, Amauri Alcindo, Alfieri, Alice Fernandes, Julio Cesar De ,freitas, Caio Abercio Da ,silva, Freire, Roberta Lemos, Barros, Andrea Rodrigues, Barreiros, Marco Antonio Bacellar, Muller, Ernst EckehardtAbstract:No presente trabalho é descrita a etiologia de um foco de diarréia em leitões de creche em uma granja de ciclo completo. Os exames laboratoriais mostraram o envolvimento simultâneo de E. coli, rotavirus, picobirnavírus e Cryptosporidium parvum. Em-células VERO três amostras de E. coli produziram LT(toxina termolábil) e cinco VT (verotoxina). This work describes the etiology of a postweaning diarrhoea focus in a intensive piggery. The results of identification procedures showed the simultaneous occurrence of Escherichia coli, rotavirus, Picobirnavirus and Cryptosporidium parvum. In VERO cells culture, was detected the LT (termolabile toxin) production by three E. coli samples and VT (verotoxin) production by five samples
Amauri Alcindo Alfieri - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
-
Segmented double-stranded genomic RNA viruses in fecal samples from broiler chicken Vírus com genoma RNA fita-dupla segmentado em fezes de frangos de corte
Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2003Co-Authors: Claudia Yurika Tamehiro, Alice Fernandes Alfieri, Cristina Médici, Amauri Alcindo AlfieriAbstract:Segmented double-stranded RNA (dsRNA) viruses were identified by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) technique in fecal samples from broiler chicken. A total of 378 fecal samples from 1-7 weeks old chickens were analyzed. dsRNA with migration profile characteristic of avian rotavirus (AvRV), reovirus (ARV) or Picobirnavirus (PBV) was identified in 32 (8.5%), 7 (1.8%) and 13 (3.4%) samples, respectively. AvRV and ARV occurred more frequently in chickens up to 1 month old and were related with enteritis signs. Considering only fecal samples of chickens with diarrhea, the AvRV was detected in 37.8% (14/37) and the ARV in 13.5% (5/37) of analyzed samples. AvRV was identified in only 1.5% (4/274) and ARV was not detected in normal feces collected from assymptomatic chickens (controls). PBV dsRNA was detected in broiler chickens from two to seven weeks old, more frequently in feces with pasty consistency. The AvRV showed great electrophoretic profile variability in the dsRNA segments and nine different electropherotypes were identified. Variation in genome pattern was not observed in either ARV or PBV.A técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida foi utilizada com o objetivo de identificar vírus com genoma contituído por RNA de fita dupla (dsRNA) segmentado, em material fecal de frangos de corte. Foram analisadas 378 amostras de fezes de aves, com idade entre a primeira e sétima semanas de vida, provenientes de granjas avícolas localizadas no Estado do Paraná, Brasil. dsRNA com perfil de migração característico de rotavírus (AvRV), reovírus (ARV) ou picobirnavírus (PBV), foi identificado em 32 (8,5%), 7 (1,8%) e 13 (3,4%) amostras, respectivamente. AvRV e ARV ocorreram com maior freqüência em aves com até um mês de idade e estiveram diretamente relacionados a fezes diarréicas e pastosas, provenientes de aves com sinais clínicos de enterite. Considerando-se apenas as amostras de fezes colhidas em aves com diarréia, o AvRV foi detectado em 37,8% (14/37) e o ARV em 13,5% (5/37) da amostragem analisada. Em fezes com aspectos normais (controle) obtidas de aves clinicamente sadias, o AvRV foi identificado em apenas 1,5% (4/274) e o ARV não foi detectado. O ácido nucléico do PBV foi detectado com maior freqüência em fezes pastosas colhidas de aves com duas a sete semanas de vida. O AvRV apresentou grande variabilidade eletroforética dos segmentos de dsRNA, tendo sido identificados nove eletroferotipos distintos. Não foram observadas variações no perfil genômico nas amostras de ARV e também de PBV
-
Enteric virus with segmented double-stranded RNA genome in broiler chicken: Rotavirus, Reovirus and Picobirnavirus / Virus entéricos RNA fita dupla, segmentado, em aves: Rotavírus, Reovírus e Picobirnavírus
Universidade Estadual de Londrina, 2000Co-Authors: Amauri Alcindo Alfieri, Claudia Yurika Tamehiro, Alice Fernandes AlfieriAbstract:Enteric infections account for considerable economic losses to the poultry industry through weight loss, low food conversion, direct and indirect expenses with treatments and increased death rates. Poultry intestinal pathologies, either with local or general manifestations, can be caused by bacteria, protozoa or virus, acting alone or in association. Regarding viral etiology, several genera have been isolated from poultry with enteric disease. However, two genera from the Reoviridae family, the rotavirus and the reovirus are found more frequently in broiler chicken and/or laying hen feces. These viruses have been associated with clinical signs of enteritis in most epidemiological research. This revision aims to present some topics on the etiological agents (rotavirus, reovirus and Picobirnavirus), the clinical disease and the diagnostic and control methods and prophylaxis of the infection.As infecções entéricas são responsáveis por consideráveis prejuízos econômicos à indústria avícola representados por perda de peso, baixa conversão alimentar, custos diretos e indiretos com tratamentos e por aumento na taxa de mortalidade. As patologias intestinais em aves, tanto com manifestação local quanto geral, podem ser determinadas por bactérias, protozoários e vírus, atuando de forma isolada ou em associação. Com relação a etiologia virai, vários gêneros têm sido isolados a partir de aves com enteropatias. Porém, dois gêneros na família Reoviridae, o rotavírus e o reovírus são encontrados com maior freqüência em fezes de frangos de corte e/ou galinhas poedeiras. Na maioria dos inquéritos epidemiológicos esses vírus estão associados a sinais clínicos de enterite. Esta revisão tem por objetivo apresentar alguns tópicos relativos aos agentes etiológicos (Rotavírus, Reovírus e Picobirnavírus), à doença clínica e aos métodos de diagnóstico, controle e profilaxia da infecção
René Ribeiro Da ,silva - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
-
Detecção, epidemiologia e análise molecular de rotavírus, picobirnavírus e reovírus em aves de corte criadas em granjas na mesorregião metropolitana de Belém, Pará, Brasil
2012Co-Authors: René Ribeiro Da ,silvaAbstract:Este estudo objetivou investigar a ocorrência de rotavírus aviário (RVA), picobirnavírus (PBV) e reovírus aviário (ARV) em aves de corte criadas em granjas situadas na Mesorregião Metropolitana de Belém, Pará, no período compreendido entre 2008 a 2011. Para tal, foram colhidos 85 pools de amostras fecais provenientes de 37 granjas pertencentes a oito municípios. O RNA viral foi extraído a partir das suspensões fecais e submetido à eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA) seguido da RT-PCR. Foi selecionada pelo menos uma amostra de cada município positivo para o sequenciamento de nucleotídeos dos genes NSP4 (rotavírus), RdRp (picobirnavírus) e S2 (reovírus), sendo que no caso dos picobirnavírus as amostras foram clonadas antes do sequenciamento. A EGPA demonstrou positividade em 0/85 (0%) amostras para RVA do grupo A, 13/85 (15,3%) amostras para PBV e 01/85 (1,2%) amostras para ARV. No caso da RT-PCR foi verificado positividade em 35/85 (41,2%), 42/85 (49,4%) e 28/85 (32,9%) das amostras para RVA, PBV e ARV, respectivamente. Dos oito municípios estudados, sete apresentaram amostras positivas para PBV e seis apresentaram amostras positivas para RVA e ARV. Das 37 granjas estudadas foi observada a presença dessas infecções virais em 19 (51,4%) para RVA e ARV e 21 (56,8%) para PBV. As sequências do gene NSP4 apresentaram entre 86,3 e 90,5% de similaridade ao nível de nucleotídeo (nt) com protótipos de frangos e 93,5 e 100% de similaridade ao nível de nt quando comparadas entre si. As sequências do gene RdRp apresentaram uma grande heterogeneidade genética com variantes gênicas apresentando entre 56,1 e 100% de similaridade ao nível de nt com protótipos pertencentes a várias espécies e fontes de contaminação e entre 50,3 e 100% de similaridade ao nível nt quando comparadas entre si. Na análise das sequências do gene S2 de ARV foi observado entre 90,9 e 94,4% de similaridade ao nível de nt com protótipos de frangos e 90,1 e 100% de similaridade ao nível de nt quando comparadas entre si. Os RVA, PBV e ARV foram detectados em granjas de frangos de corte da Mesorregião Metropolitana de Belém, sendo a detecção por RT-PCR a mais eficiente ao detectar pelo menos um dos vírus nos oito municípios pesquisados. Excetuando-se o PBV, que apresentou relacionamento heterogêneo com os protótipos utilizados, o RVA e ARV deste estudo relacionaram-se especificamente com amostras obtidas em aves. Este é o primeiro estudo envolvendo o sequenciamento gênico do RVA, PBV e ARV em frangos de corte na região norte do Brasil.ABSTRACT: This study aimed to investigate the occurrence of avian rotavirus (AvRV), Picobirnavirus (PBV) and avian reovirus (ARV) in chickens raised on farms located in the Metropolitan mesoregion of Belém, Pará state, in the period of 2008 to 2011. For this purpose, 85 pools of fecal samples were collected from 37 farms belonging to eight counties. Viral RNA was extracted from fecal suspensions and subjected to polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) followed by RT-PCR. At least one sample was selected of each municipality wich positive result for nucleotide sequencing of the genes NSP4 (AvRV), RdRp (PBV) and S2 (ARV), and in the case of the PBV samples were cloned before sequencing. PAGE showed positive in 0/85 (0%) samples for AvRV group A, 13/85 (15.3%) samples for PBV and 01/85 (1.2%) samples for ARV. In the case of RT-PCR positive results was observed in 35/85 (41.2%), 42/85 (49.4%) and 28/85 (32.9%) of the samples for AvRV, ARV and PBV, respectively. Of the eight counties studied, seven showed positivity to PBV, and six for AvRV and ARV. Of the 37 farms studied the presence of these viral infections was observed in 19 (51.4%) to AvRV and ARV and 21 (56.8%) to PBV. NSP4 gene sequences had a similarity between 86.3 and 90.5% at the nucleotide level (nt) with prototypes from chicken and 93.5 and 100% similarity at the nt level when compared among them. RdRp sequences showed a high genetic heterogeneity with gene variants resulting between 56.1 and 100% similarity at the nt level with prototypes belonging to different species and sources of contamination and between 50.3 and 100% similarity at nt level when compared among them. S2 gene sequences analysis showed between 90.9 and 94.4% similarity at the nt level with chicken prototypes and 90.1 and 100% similarity at the nt level when compared each other. AvRV, ARV and PBV were detected in broiler farms of the Metropolitan mesoregion of Belém, being the detection by RT-PCR more efficient to detect at least one type of virus in the eight counties surveyed. Except for the PBV, which showed heterogeneous relationship with the prototypes used, the AvRV and ARV of this study related specifically to the samples obtained in birds. This is the first study involving the genomic sequencing of the AvRV, ARV and PBV in broilers in northern Brazil
-
Detecção, epidemiologia e análise molecular de rotavírus, picobirnavírus e reovírus em aves de corte criadas em granjas na mesorregião metropolitana de Belém, Pará, Brasil
Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais, 2012Co-Authors: René Ribeiro Da ,silvaAbstract:This study aimed to investigate the occurrence of avian rotavirus (AvRV), Picobirnavirus (PBV) and avian reovirus (ARV) in chickens raised on farms located in the Metropolitan mesoregion of Belém, Pará state, in the period of 2008 to 2011. For this purpose, 85 pools of fecal samples were collected from 37 farms belonging to eight counties. Viral RNA was extracted from fecal suspensions and subjected to polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) followed by RT-PCR. At least one sample was selected of each municipality wich positive result for nucleotide sequencing of the genes NSP4 (AvRV), RdRp (PBV) and S2 (ARV), and in the case of the PBV samples were cloned before sequencing. PAGE showed positive in 0/85 (0%) samples for AvRV group A, 13/85 (15.3%) samples for PBV and 01/85 (1.2%) samples for ARV. In the case of RT-PCR positive results was observed in 35/85 (41.2%), 42/85 (49.4%) and 28/85 (32.9%) of the samples for AvRV, ARV and PBV, respectively. Of the eight counties studied, seven showed positivity to PBV, and six for AvRV and ARV. Of the 37 farms studied the presence of these viral infections was observed in 19 (51.4%) to AvRV and ARV and 21 (56.8%) to PBV. NSP4 gene sequences had a similarity between 86.3 and 90.5% at the nucleotide level (nt) with prototypes from chicken and 93.5 and 100% similarity at the nt level when compared among them. RdRp sequences showed a high genetic heterogeneity with gene variants resulting between 56.1 and 100% similarity at the nt level with prototypes belonging to different species and sources of contamination and between 50.3 and 100% similarity at nt level when compared among them. S2 gene sequences analysis showed between 90.9 and 94.4% similarity at the nt level with chicken prototypes and 90.1 and 100% similarity at the nt level when compared each other. AvRV, ARV and PBV were detected in broiler farms of the Metropolitan mesoregion of Belém, being the detection by RT-PCR more efficient to detect at least one type of virus in the eight counties surveyed. Except for the PBV, which showed heterogeneous relationship with the prototypes used, the AvRV and ARV of this study related specifically to the samples obtained in birds. This is the first study involving the genomic sequencing of the AvRV, ARV and PBV in broilers in northern Brazil.FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e PesquisasEste estudo objetivou investigar a ocorrência de rotavírus aviário (RVA), picobirnavírus (PBV) e reovírus aviário (ARV) em aves de corte criadas em granjas situadas na Mesorregião Metropolitana de Belém, Pará, no período compreendido entre 2008 a 2011. Para tal, foram colhidos 85 pools de amostras fecais provenientes de 37 granjas pertencentes a oito municípios. O RNA viral foi extraído a partir das suspensões fecais e submetido à eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA) seguido da RT-PCR. Foi selecionada pelo menos uma amostra de cada município positivo para o sequenciamento de nucleotídeos dos genes NSP4 (rotavírus), RdRp (picobirnavírus) e S2 (reovírus), sendo que no caso dos picobirnavírus as amostras foram clonadas antes do sequenciamento. A EGPA demonstrou positividade em 0/85 (0%) amostras para RVA do grupo A, 13/85 (15,3%) amostras para PBV e 01/85 (1,2%) amostras para ARV. No caso da RT-PCR foi verificado positividade em 35/85 (41,2%), 42/85 (49,4%) e 28/85 (32,9%) das amostras para RVA, PBV e ARV, respectivamente. Dos oito municípios estudados, sete apresentaram amostras positivas para PBV e seis apresentaram amostras positivas para RVA e ARV. Das 37 granjas estudadas foi observada a presença dessas infecções virais em 19 (51,4%) para RVA e ARV e 21 (56,8%) para PBV. As sequências do gene NSP4 apresentaram entre 86,3 e 90,5% de similaridade ao nível de nucleotídeo (nt) com protótipos de frangos e 93,5 e 100% de similaridade ao nível de nt quando comparadas entre si. As sequências do gene RdRp apresentaram uma grande heterogeneidade genética com variantes gênicas apresentando entre 56,1 e 100% de similaridade ao nível de nt com protótipos pertencentes a várias espécies e fontes de contaminação e entre 50,3 e 100% de similaridade ao nível nt quando comparadas entre si. Na análise das sequências do gene S2 de ARV foi observado entre 90,9 e 94,4% de similaridade ao nível de nt com protótipos de frangos e 90,1 e 100% de similaridade ao nível de nt quando comparadas entre si. Os RVA, PBV e ARV foram detectados em granjas de frangos de corte da Mesorregião Metropolitana de Belém, sendo a detecção por RT-PCR a mais eficiente ao detectar pelo menos um dos vírus nos oito municípios pesquisados. Excetuando-se o PBV, que apresentou relacionamento heterogêneo com os protótipos utilizados, o RVA e ARV deste estudo relacionaram-se especificamente com amostras obtidas em aves. Este é o primeiro estudo envolvendo o sequenciamento gênico do RVA, PBV e ARV em frangos de corte na região norte do Brasil
Ré Viviana Elizabeth - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
-
Aguas del río suquía: monitoreo y evaluación de riesgo de transmisión hídrica de virus entéricos con impacto en salud humana
2012Co-Authors: Ré Viviana Elizabeth, Nates, Silvia VivianaAbstract:El agua es una fuente importante de diseminación de agentes virales que se transmiten por vía fecal-oral y que genéricamente se denominan virus entéricos. Nuestro país constituye una zona endémica para algunos de estos virus (hepatitis A, rotavirus, adenovirus, astrovirus, norovirus, enterovirus no polio) y por lo tanto la excreción fecal de estos virus puede considerarse permanente. Asimismo, los individuos infectados con virus entéricos emergentes, como es el virus de hepatitis E (HEV) y Picobirnavirus, también los eliminan por materia fecal. De este modo, las aguas residuales constituyen una matriz hídrica con alta carga viral. En las últimas décadas se ha incrementado la fragilidad de los sistemas hídricos, reflejada en las dificultades para la evacuación de aguas residuales y la contaminación de espacios acuáticos destinados a recreación. En este marco, se vería favorecida la diseminación de virus entéricos en matrices acuosas superficiales, constituyendo estas aguas un riesgo de infección para la población expuesta. La legislación vigente establece, para el control de la contaminación microbiana de las aguas, el uso de indicadores estándares bacterianos. Sin embargo, recientes estudios han demostrado que estos indicadores no revelan satisfactoriamente la calidad viral de las aguas, por lo que el monitoreo específico de los virus humanos en aguas superficiales cobra particular importancia. Objetivo general: llevar adelante un proyecto de desarrollo y transferencia de tecnologías, basado en una gestión integrada en red de investigación, para la recuperación, identificación, cuantificación y caracterización molecular de virus responsables de enfermedades de transmisión hídrica con impacto en la salud pública, en aguas del Río Suquía de la Provincia de Córdoba. Resultados esperados: se pretende como producto del desarrollo de este proyecto describir la calidad virológica de las aguas del Río Suquía y arribar a una propuesta para el monitoreo viral de aguas superficiales y la evaluación de riesgo de transmisión hídrica de virus entéricos a población expuesta. Importancia del proyecto: Aportar información a los programas sanitarios de la región sobre la situación de contaminación viral del Río Suquía, a fin de reforzar el sistema de saneamiento ambiental, mejorar el diagnóstico de calidad microbiológica de aguas superficiales e impulsar a programas de control para atenuar la diseminación de virus entéricos en nuestro medio. Los datos sobre el virus HEV serán los primeros disponibles para la región.Fil: Re, Viviana Elizabeth. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Nates, Silvia Viviana. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; Argentin
-
Aguas del río suquía: monitoreo y evaluación de riesgo de transmisión hídrica de virus entéricos con impacto en salud humana.
2012Co-Authors: Ré Viviana Elizabeth, Nates SilviaAbstract:El agua es una fuente importante de diseminación de agentes virales que se transmiten por vía fecal-oral y que genéricamente se denominan virus entéricos. Nuestro país constituye una zona endémica para algunos de estos virus (hepatitis A, rotavirus, adenovirus, astrovirus, norovirus, enterovirus no polio) y por lo tanto la excreción fecal de estos virus puede considerarse permanente. Asimismo, los individuos infectados con virus entéricos emergentes, como es el virus de hepatitis E (HEV) y Picobirnavirus, también los eliminan por materia fecal. De este modo, las aguas residuales constituyen una matriz hídrica con alta carga viral. En las últimas décadas se ha incrementado la fragilidad de los sistemas hídricos, reflejada en las dificultades para la evacuación de aguas residuales y la contaminación de espacios acuáticos destinados a recreación. En este marco, se vería favorecida la diseminación de virus entéricos en matrices acuosas superficiales, constituyendo estas aguas un riesgo de infección para la población expuesta. La legislación vigente establece, para el control de la contaminación microbiana de las aguas, el uso de indicadores estándares bacterianos. Sin embargo, recientes estudios han demostrado que estos indicadores no revelan satisfactoriamente la calidad viral de las aguas, por lo que el monitoreo específico de los virus humanos en aguas superficiales cobra particular importancia. Objetivo general: llevar adelante un proyecto de desarrollo y transferencia de tecnologías, basado en una gestión integrada en red de investigación, para la recuperación, identificación, cuantificación y caracterización molecular de virus responsables de enfermedades de transmisión hídrica con impacto en la salud pública, en aguas del Río Suquía de la Provincia de Córdoba. Resultados esperados: se pretende como producto del desarrollo de este proyecto describir la calidad virológica de las aguas del Río Suquía y arribar a una propuesta para el monitoreo viral de aguas superficiales y la evaluación de riesgo de transmisión hídrica de virus entéricos a población expuesta. Importancia del proyecto: Aportar información a los programas sanitarios de la región sobre la situación de contaminación viral del Río Suquía, a fin de reforzar el sistema de saneamiento ambiental, mejorar el diagnóstico de calidad microbiológica de aguas superficiales e impulsar a programas de control para atenuar la diseminación de virus entéricos en nuestro medio. Los datos sobre el virus HEV serán los primeros disponibles para la región
-
AGUAS DEL RÍO SUQUÍA: MONITOREO Y EVALUACIÓN DE RIESGO DE TRANSMISIÓN HÍDRICA DE VIRUS ENTÉRICOS CON IMPACTO EN SALUD HUMANA.
2010Co-Authors: Nates, Silvia Viviana, Isa M. Beatríz, Paván Jorge, Barril Patricia, Elbarcha Osvaldo, Ré Viviana Elizabeth, Welter Adriana, Martinez Wassaf Maribel Graciela, Zitta Eugenia, Grumelli YaninaAbstract:El agua es una fuente importante de diseminación de agentes virales que se transmiten por vía fecal-oral y que genéricamente se denominan virus entéricos. Nuestro país constituye una zona endémica para algunos de estos virus (hepatitis A (HAV), rotavirus, adenovirus, astrovirus, norovirus, enterovirus no polio) y por lo tanto la excreción fecal de estos virus puede considerarse permanente. Asimismo, los individuos infectados con virus entéricos emergentes, como es el virus de hepatitis E (HEV) y Picobirnavirus, también los eliminan por materia fecal. De este modo, las aguas residuales constituyen una matriz hídrica con alta carga viral. En las últimas décadas se ha incrementado la fragilidad de los sistemas hídricos, reflejada en las dificultades para la evacuación de aguas residuales y la contaminación de espacios acuáticos destinados a recreación. En este marco, se vería favorecida la diseminación de virus entéricos en matrices acuosas superficiales, constituyendo éstas aguas un riesgo de infección para la población expuesta. La legislación vigente establece, para el control de la contaminación microbiana de las aguas, el uso de indicadores estándares bacterianos. Sin embargo, recientes estudios han demostrado que estos indicadores no revelan satisfactoriamente la calidad viral de las aguas, por lo que el monitoreo específico de los virus humanos en aguas superficiales cobra particular importancia. El objetivo general: llevar adelante un proyecto de desarrollo y transferencia de tecnologías, basado en una gestión integrada en red de investigación, para la recuperación, identificación, cuantificación y caracterización molecular de virus responsables de enfermedades de transmisión hídrica con impacto en la salud pública, en aguas del Río Suquía de la Provincia de Córdoba. Los objetivos específicos planteados son: -Implementar metodologías para concentración de virus a partir de muestras de aguas y para la extracción de los ácidos nucleicos de los concentrados.-Desarrollar e Implementar métodos moleculares para detección de rotavirus, norovirus, astrovirus, enterovirus, HAV, HEV, picovirnavirus y poliomavirus en aguas del río Suquía.-Caracterizar molecularmente los aislamientos virales (secuenciamiento y análisis filogenéticos).-Cuantificar rotavirus y enterovirus viable en las aguas analizadas.-Determinar la correlación genómica/serológica y las relaciones filogenéticas entre los virus detectados en aguas del Río, en cloacas (circulación poblacional de virus) y en población humana y animal, específicamente para HEV.-Evaluar la correlación entre los parámetros fisicoquímicos y bacteriológicos utilizados como indicadores de la calidad de agua y la detección cualitativa y cuantitativa viral. -Confeccionar mapas que reflejen la contaminación viral estacional del Río Suquía. -Evaluar el riesgo de transmisión hídrica de virus entéricos a población expuesta.-Consolidar la red de investigación a través de la formación de recursos humanos y la divulgación de las actividades y resultados obtenidos. Resultados esperados: Se pretende como producto del desarrollo de este proyecto describir la calidad virológica de las aguas del Río Suquía y arribar a una propuesta para el monitoreo viral de aguas superficiales y la evaluación de riesgo de transmisión hídrica de virus entéricos a población expuesta. Importancia del proyecto: Aportar información a los programas sanitarios de la región sobre la situación de contaminación viral del Río Suquía, a fin de reforzar el sistema de saneamiento ambiental, mejorar el diagnóstico de calidad microbiológica de aguas superficiales e impulsar a programas de control para atenuar la diseminación de virus entéricos en nuestro medio. Los datos sobre el virus HEV serán los primeros disponibles para la región