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Dufey Joseph - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Utilisation agricole de plantes aquatiques, notamment en tant qu'amendement des sols, dans la province de Thua Thien Hue, Centre Vietnam. 1. Inventaire, abondance et caractérisation chimique des plantes aquatiques disponibles localement.
A G C D - A B O S, 2009Co-Authors: Ancion Pierre, Hoang, Thi Thai Hoa, Ton That Phap, Quang Tu Pham, Chiang Claude, Dufey JosephAbstract:Une pratique empirique fréquente au Centre Vietnam est d’utiliser des plantes aquatiques à diverses fins, et notamment en tant qu’amendement des sols. Cette pratique contribue à augmenter les entrées de matière organique dans les systèmes de production, ce qui est particulièrement crucial dans les zones sableuses où les sols sont intrinsèquement peu fertiles. Dans la province de Thua Thien Hue, la grande lagune de Tam Giang (22.000 ha) constitue une source potentiellement très importante de biomasse exogène pour l’agriculture. La présente étude dresse un inventaire des macrophytes submergés et des algues de la lagune durant la période février-avril 2005. Douze espèces de macrophytes appartenant aux familles des Potamogetonaceae, Najadaceae, Cymodoceaceae, Hydrocharitaceae, Ceratophyllaceae et Haloragaceae, et 5 espèces d’algues appartenant aux familles des Ulvaceae, Cladophoraceae, Characeae et Gracilariaceae ont été identifiées. Leur abondance varie fortement en fonction de l’espèce et de la position dans la lagune qui conditionne le niveau de salinité, la profondeur et le type de sédiments dans lequel s’ancrent les macrophytes. Les biomasses fraîches les plus importantes pour des tapis végétaux monospécifiques ont été relevées pour Vallisneria spiralis (3,1 kg.m-2), Najas indica (2,9 k.m-2), Halodule tridentata (2,5 kg.m-2) et Cymodoceae rotundata (2,3 kg.m-2). Toutes les plantes ont été collectées selon les techniques des agriculteurs et leur composition chimique a été déterminée. Pour les macrophytes, les gammes de teneurs suivantes ont été mesurées (en % de la matière sèche): N 1,0 à 3,5; P 0,08 à 0,45; K 1,0 à 4,2;Mg0,3à1,4;Ca0,7à2,8;Na0,7à7,6;cequimet en évidence des valeurs fertilisantes potentielles très différentes selon les espèces. Les algues présentent des teneurs encore plus contrastées selon les espèces pour la plupart de ces éléments. La teneur en Na est partiellement expliquée par le niveau de salinité du lieu de prélèvement
Hoang, Thi Thai Hoa - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Utilisation agricole de plantes aquatiques, notamment en tant qu'amendement des sols, dans la province de Thua Thien Hue, Centre Vietnam. 1. Inventaire, abondance et caractérisation chimique des plantes aquatiques disponibles localement.
A G C D - A B O S, 2009Co-Authors: Ancion Pierre, Hoang, Thi Thai Hoa, Ton That Phap, Quang Tu Pham, Chiang Claude, Dufey JosephAbstract:Une pratique empirique fréquente au Centre Vietnam est d’utiliser des plantes aquatiques à diverses fins, et notamment en tant qu’amendement des sols. Cette pratique contribue à augmenter les entrées de matière organique dans les systèmes de production, ce qui est particulièrement crucial dans les zones sableuses où les sols sont intrinsèquement peu fertiles. Dans la province de Thua Thien Hue, la grande lagune de Tam Giang (22.000 ha) constitue une source potentiellement très importante de biomasse exogène pour l’agriculture. La présente étude dresse un inventaire des macrophytes submergés et des algues de la lagune durant la période février-avril 2005. Douze espèces de macrophytes appartenant aux familles des Potamogetonaceae, Najadaceae, Cymodoceaceae, Hydrocharitaceae, Ceratophyllaceae et Haloragaceae, et 5 espèces d’algues appartenant aux familles des Ulvaceae, Cladophoraceae, Characeae et Gracilariaceae ont été identifiées. Leur abondance varie fortement en fonction de l’espèce et de la position dans la lagune qui conditionne le niveau de salinité, la profondeur et le type de sédiments dans lequel s’ancrent les macrophytes. Les biomasses fraîches les plus importantes pour des tapis végétaux monospécifiques ont été relevées pour Vallisneria spiralis (3,1 kg.m-2), Najas indica (2,9 k.m-2), Halodule tridentata (2,5 kg.m-2) et Cymodoceae rotundata (2,3 kg.m-2). Toutes les plantes ont été collectées selon les techniques des agriculteurs et leur composition chimique a été déterminée. Pour les macrophytes, les gammes de teneurs suivantes ont été mesurées (en % de la matière sèche): N 1,0 à 3,5; P 0,08 à 0,45; K 1,0 à 4,2;Mg0,3à1,4;Ca0,7à2,8;Na0,7à7,6;cequimet en évidence des valeurs fertilisantes potentielles très différentes selon les espèces. Les algues présentent des teneurs encore plus contrastées selon les espèces pour la plupart de ces éléments. La teneur en Na est partiellement expliquée par le niveau de salinité du lieu de prélèvement
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Utilisation agricole de plantes aquatiques, notamment en tant qu'amendement des sols, dans la province de Thua Thien Hue, Centre Vietnam. 1. Inventaire, abondance et caractérisation chimique des plantes aquatiques disponibles localement
AGRI-OVERSEAS, 2009Co-Authors: Py. Ancion, Hoang, Thi Thai Hoa, Ton That P., Pham Khanh T., Cn. Chiang, Je. DufeyAbstract:Agricultura Use of Aquatic Plants, mainly as Soil Amendment, in the Thua Thien Hue Province, Central Vietnam. 1. Inventory, Abundance and Chemical Characterization of Collected Plants. The use of aquatic plants for various purposes, and notably as organic amendment for sandy soils with low inherent fertility is a frequent empirical practice in Central Vietnam. In the Thua Thien Hue Province, the Tam Giang lagoon covering 22,000 ha represents a source of exogenous biomass potentially important for agriculture. The present study makes an inventory of the submerged macrophytes and the algae occurring in the lagoon during the period of February-April 2005. Twelve species of macrophytes (belonging to the Potamogetonaceae, Najadaceae, Cymodoceaceae, Hydrocharitaceae, Ceratophyllaceae, and Haloragaceae families) and five of algae (belonging to the Ulvaceae, Cladophoraceae, Characeae, and Gracilariaceae families) were identified. Their abundance varies significantly following species and location in the lagoon. Indeed, the salt concentration, the water depth and the type of sediments in which the macrophytes are anchored are submitted to large variations depending on position in the lagoon. The highest values of fresh biomass measured for monospecific vegetal mats were observed for Vallisneria spiralis (3.1 kg.m-2), Najas indica (2.9 kg.m-2), Halodule tridentata (2.5 kg.m-2) and Cymodoceae rotundata (2.3 kg.m-2). The concentrations of main elements were determined in samples of all plant species. In the macrophytes, the following ranges of element concentrations (in % of dry matter) were found: N 1.0 to 3.5; P 0.08 to 0.45; K 1.0 to 4.2; Mg 0.3 to 1.4; Ca 0.7 to 2.8; Na 0.7 to 7.6. These variations indicate that the fertilization capacity of aquatic plants when they are used as soil amendment can vary to a large extent according to the species. Even more contrasted element concentrations were found for the algae. The Na concentrations in the collected plants can be partly explained by the salinity level met in the sampling areas
Jariya Sakayaroj - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Antimicrobial potential of endophytic fungi derived from three seagrass species: Cymodocea serrulata, Halophila ovalis and Thalassia hemprichii
2016Co-Authors: Preuttiporn Supaphon, Souwalak Phongpaichit, Vatcharin Rukachaisirikul, Jariya SakayarojAbstract:Endophytic fungi from three commonly found seagrasses in southern Thailand were explored for their ability to produce antimicrobial metabolites. One hundred and sixty endophytic fungi derived from Cymodocea serrulata (Family Cymodoceaceae), Halophila ovalis and Thalassia hemprichii (Family Hydrocharitaceae) were screened for production of antimicrobial compounds by a colorimetric broth microdilution test against ten human pathogenic microorganisms including Staphylococcus aureus ATCC 25923, a clinical isolate of methicillin-resistant S. aureus
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antimicrobial potential of endophytic fungi derived from three seagrass species cymodocea serrulata halophila ovalis and thalassia hemprichii
PLOS ONE, 2013Co-Authors: Preuttiporn Supaphon, Souwalak Phongpaichit, Vatcharin Rukachaisirikul, Jariya SakayarojAbstract:Endophytic fungi from three commonly found seagrasses in southern Thailand were explored for their ability to produce antimicrobial metabolites. One hundred and sixty endophytic fungi derived from Cymodoceaserrulata (Family Cymodoceaceae), Halophilaovalis and Thalassiahemprichii (Family Hydrocharitaceae) were screened for production of antimicrobial compounds by a colorimetric broth microdilution test against ten human pathogenic microorganisms including Staphylococcus aureus ATCC 25923, a clinical isolate of methicillin-resistant S. aureus, Escherichia coli ATCC 25923, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Candida albicans ATCC 90028 and NCPF 3153, Cryptococcus neoformans ATCC 90112 and ATCC 90113 and clinical isolates of Microsporumgypseum and Penicilliummarneffei. Sixty-nine percent of the isolates exhibited antimicrobial activity against at least one test strain. Antifungal activity was more pronounced than antibacterial activity. Among the active fungi, seven isolates including Hypocreales sp. PSU-ES26 from C. serrulata, Trichoderma spp. PSU-ES8 and PSU-ES38 from H. ovalis, and Penicillium sp. PSU-ES43, Fusarium sp. PSU-ES73, Stephanonectria sp. PSU-ES172 and an unidentified endophyte PSU-ES190 from T. hemprichii exhibited strong antimicrobial activity against human pathogens with minimum inhibitory concentrations (MIC) of less than 10 µg/ml. The inhibitory extracts at concentrations of 4 times their MIC destroyed the targeted cells as observed by scanning electron microscopy. These results showed the antimicrobial potential of extracts from endophytic fungi from seagrasses.
Je. Dufey - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Utilisation agricole de plantes aquatiques, notamment en tant qu'amendement des sols, dans la province de Thua Thien Hue, Centre Vietnam. 1. Inventaire, abondance et caractérisation chimique des plantes aquatiques disponibles localement
AGRI-OVERSEAS, 2009Co-Authors: Py. Ancion, Hoang, Thi Thai Hoa, Ton That P., Pham Khanh T., Cn. Chiang, Je. DufeyAbstract:Agricultura Use of Aquatic Plants, mainly as Soil Amendment, in the Thua Thien Hue Province, Central Vietnam. 1. Inventory, Abundance and Chemical Characterization of Collected Plants. The use of aquatic plants for various purposes, and notably as organic amendment for sandy soils with low inherent fertility is a frequent empirical practice in Central Vietnam. In the Thua Thien Hue Province, the Tam Giang lagoon covering 22,000 ha represents a source of exogenous biomass potentially important for agriculture. The present study makes an inventory of the submerged macrophytes and the algae occurring in the lagoon during the period of February-April 2005. Twelve species of macrophytes (belonging to the Potamogetonaceae, Najadaceae, Cymodoceaceae, Hydrocharitaceae, Ceratophyllaceae, and Haloragaceae families) and five of algae (belonging to the Ulvaceae, Cladophoraceae, Characeae, and Gracilariaceae families) were identified. Their abundance varies significantly following species and location in the lagoon. Indeed, the salt concentration, the water depth and the type of sediments in which the macrophytes are anchored are submitted to large variations depending on position in the lagoon. The highest values of fresh biomass measured for monospecific vegetal mats were observed for Vallisneria spiralis (3.1 kg.m-2), Najas indica (2.9 kg.m-2), Halodule tridentata (2.5 kg.m-2) and Cymodoceae rotundata (2.3 kg.m-2). The concentrations of main elements were determined in samples of all plant species. In the macrophytes, the following ranges of element concentrations (in % of dry matter) were found: N 1.0 to 3.5; P 0.08 to 0.45; K 1.0 to 4.2; Mg 0.3 to 1.4; Ca 0.7 to 2.8; Na 0.7 to 7.6. These variations indicate that the fertilization capacity of aquatic plants when they are used as soil amendment can vary to a large extent according to the species. Even more contrasted element concentrations were found for the algae. The Na concentrations in the collected plants can be partly explained by the salinity level met in the sampling areas
Kusumasari Andini - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Identifikasi Lamun Menggunakan Dna Kloroplas Gen Rbcl (Ribulose-1,5-Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase) Dan Gen Matk (Megakaryocyte-Associated Tyrosine Kinase) Dari Perairan Kabupaten Malang Dan Kabup
2014Co-Authors: Kusumasari AndiniAbstract:Semakin pesatnya kegiatan perikanan seperti eksploitasi berlebihan melalui penggunaan lahan, pengerukan pertambangan, aktivitas perkapalan dan kegiatan perikanan lainnya menyebabkan lamun rentan terhadap kerusakan. Dampak dari kegiatan perikanan umumnya berupa hancurnya padang lamun sehingga menjadi potongan daun lamun yang mengambang di permukaan perairan sehingga sulit untuk diidentifikasi secara morfologi. Oleh karena itu, DNA barcoding dapat dimanfaatkan dalam penelitian ini untuk identifikasi lamun. DNA barcode sebagai cara untuk mengidentifikasi hingga tingkat spesies dengan menggunakan wilayah gen yang paling efektif untuk identifikasi spesies. Wilayah gen yang digunakan dalam standar barcode untuk hampir semua kelompok hewan adalah COI. Gen COI terbukti efektik dalam mengidentifikasi burung, kupu-kupu, ikan dan banyak kelompok hewan lainnya. Namun gen COI bukan merupakan barcode yang efektif pada tumbuhan karena rendahnya tingkat perubahan sekuen dan variabilitas yang rendah antar spesies, tapi dua gen di kloroplas, matK dan rbcL, telah disetujui sebagai daerah barcode untuk tanaman termasuk pada lamun. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk identifikasi spesies lamun di perairan Kab. Malang dan Kab. Lamongan secara molekuler, menentukan hubungan filogenetik dan menentukan gen yang efektif untuk analisis hubungan filogenetik. Metode yang digunakan untuk identifikasi molekuler meliputi koleksi sampel, ekstraksi yang bertujuan untuk mengisolasi DNA, PCR untuk memperbanyak DNA, elektroforesis untuk visualisasi amplifikasi DNA, sequencing dan analisis identifikasi. Sampel yang berhasil di koleksi berjumlah 21, delapan individu dari spesies Thalassia hemprichii yang diambil dari Pantai Sendang Biru, tujuh individu dari spesies Thalassia hemprichii yang diambil dari Pantai Balekambang, satu individu dari spesies Syringodium isoetifolium yang diambil dari Pantai Kondang Merak dan 5 sampel dari spesies Enhalus acoroides yang diambil dari perairan Paciran. Hasil identifikasi secara morfologi menunjukkan hasil yang sama dengan identifikasi secara molekuler bahwa sampel yang ditemukan merupakan spesies Thalassia hemprichii, Syringodium isoetifolium dan Enhalus acoroides. Hasil konstruksi pohon menunjukkan bahwa pada gen rbcL dan gen matK terdapat tiga spesies lamun T. hemprichii, E. acoroides dan S. isoetifolium yang diklasifikasikan dalam dua famili yaitu Hydrocharitaceae dan Cymodoceaceae ‘complex’. Penggunaan gen rbcL dan gen matK sangat efektif pada spesies lamun, namun diantara kedua gen tersebut gen matK lebih informatif dibandingkan dengan gen rbc
