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J. Pauquet - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Marqueurs moléculaires utilisables en sélection chez la canne à sucre : cas de la résistance à la rouille brune.
2012Co-Authors: Laurent Costet, S. Royaert, L. Toubi, H. Telismart, Y. Rousselle, Louis-marie Raboin, Loïc Le Cunff, Olivier Garsmeur, Catherine Hervouet, J. PauquetAbstract:Les cultivars modernes de canne à sucre (Saccharum spp., 2n=100 à 130) sont hautement polyploïdes, aneuploïdes et d'origine interspécifique. Un gène majeur (Bru1) conférant la résistance à la rouille brune, causée par le champignon Puccinia melanocephala, a été identifié chez le cultivar R570. Nous avons analysé 380 cultivars modernes et clones en cours de sélection, représentatifs de la diversité mondiale, à l’aide de 22 marqueurs moléculaires regroupés dans un segment de 8,2cM génétiquement lié à Bru1 chez R570. Nos résultats révèlent un fort déséquilibre de liaison dans la région autour de Bru1 et de fortes associations entre la plupart des marqueurs et la résistance à la rouille. Deux marqueurs PCR flanquant le segment portant Bru1 sont complètement associés et sont présents uniquement chez les clones résistants. Ces marqueurs constituent des marqueurs moléculaires diagnostics de Bru1. 86% des 194 clones de canne à sucre résistants possèdent les marqueurs diagnostics de Bru1, révélant que ce gène constitue la principale source de résistance à la rouille brune chez les cultivars modernes. Les marqueurs PCR diagnostics de Bru1 devraient être particulièrement utiles pour identifier des cultivars possédant des sources de résistance alternatives à Bru1 afin de diversifier la base génétique de la résistance à la rouille brune dans les programmes de sélection.
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Haplotype structure around Bru1 reveals a narrow genetic basis for brown rust resistance in modern sugarcane cultivars
Theoretical and Applied Genetics, 2012Co-Authors: L. Costet, L. Cunff, S. Royaert, L.-m. Raboin, C. Hervouet, L. Toubi, H. Telismart, O. Garsmeur, Y. Rousselle, J. PauquetAbstract:Modern sugarcane cultivars ( Saccharum spp., 2 n = 100–130) are high polyploid, aneuploid and of interspecific origin. A major gene ( Bru 1) conferring resistance to brown rust, caused by the fungus Puccinia melanocephala, has been identified in cultivar R570. We analyzed 380 modern cultivars and breeding materials covering the worldwide diversity with 22 molecular markers genetically linked to Bru 1 in R570 within a 8.2 cM segment. Our results revealed a strong LD in the Bru 1 region and strong associations between most of the markers and rust resistance. Two PCR markers, that flank the Bru 1-bearing segment, were found completely associated with one another and only in resistant clones representing efficient molecular diagnostic for Bru 1. On this basis, Bru 1 was inferred in 86 % of the 194 resistant sugarcane accessions, revealing that it constitutes the main source of brown rust resistance in modern cultivars. Bru 1 PCR diagnostic markers should be particularly useful to identify cultivars with potentially alternative sources of resistance to diversify the basis of brown rust resistance in breeding programs.
Fiallos Encalada, Freddy Fabian - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Reacción de 100 variedades de caña de azúcar (saccharum officinarum) del banco de germoplasma del CINCAE, al carbón (ustilago scitaminea sydow), roya (Puccinia melanocephala sydow) y mosaico (sugarcane mosaic virus) en la zona del cantón El Triunfo.
'Escuela Superior Politecnica del Litoral', 2016Co-Authors: Fiallos Encalada, Freddy FabianAbstract:Trabajo que propone determinar la reacción de 100 variedades de caña de azúcar del banco de germoplasma del centro de investigación de la caña de azúcar del ecuador (cincae), inoculadas con enfermedades como: mosaico común (sugarcane mosaic virus), carbón de la caña de azúcar (ustilago scitaminea sydow) y roya (Puccinia melanocephala sydow), con el fin de obtener un banco de información fitosanitaria, que sirva de herramienta en la selección de buenos progenitores para ser utilizadas en los programas de mejoramiento; así como, para prevenir la propagación de variedades susceptibles a estas enfermedades.GuayaquilIngeniero Agropecuario
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Reacción de 100 variedades de caña de azúcar (saccharum officinarum) del banco de germoplasma del cincae, al carbón (ustilago scitaminea sydow), roya (Puccinia melanocephala sydow) y mosaico (sugarcane mosaic virus) en la zona del cantón el triunfo
2010Co-Authors: Fiallos Encalada, Freddy FabianAbstract:De acuerdo al III Censo Nacional Agropecuario, en nuestro país, existen cerca de 82.749 Ha de caña de azúcar (Saccharum officinarum), destinadas para la producción industrial. Estas zonas están ubicadas en las provincias del Guayas (Ingenios Valdez y San Carlos), Cañar (Ingenió La Troncal), Los Ríos (Ingenio Isabel María), Imbabura (Ingenio Tababuela) y en Loja (Ingenio Monte Rey) (30). Este cultivo representa un rubro muy importante para el sustento diario de miles de familias ecuatorianas, ya sea desde el punto de vista económico o social, debido a que en época de cosecha o zafra en los seis ingenios azucareros, laboran aproximadamente unas 30.000 personas de manera directa y unas 80.000 indirectamente, lo que representa el 9 % de la población económicamente activa del sector agropecuario y el 12 % del PIB (Producto Interno Bruto) Agrícola. Al igual que en todo cultivo, en la Caña de Azúcar existen algunos factores que pueden interferir en el normal desarrollo de la planta, tales como las plagas y enfermedades, que pueden limitar su producción. En cuanto a las enfermedades, las que mayor importancia tienen en nuestro país, son el mosaico común (Sugarcane Mosaic Virus), el Carbón de la caña 18 de azúcar (Ustilago scitaminea Sydow) y la Roya común (Puccinia melanocephala Sydow). A través de la historia, estas enfermedades se han presentado como uno de los principales limitantes para la producción azucarera mundial. Así por ejemplo, en la segunda década del siglo XX, el virus del mosaico puso en peligro la producción azucarera latinoamericana, afectando a la variedad Cristalina. También existen otros antecedentes de enfermedades como el Carbón y la Roya, que han alcanzado niveles críticos en diferentes variedades sembradas comercialmente en su época. Ante esta situación, la mayoría de países productores de Caña de Azúcar, incluido el Ecuador, tienen un banco de germoplasma o colección de variedades, con el fin de tener una fuente de diversidad varietal o de respaldo, que les permita sustituir variedades susceptibles a ciertas enfermedades o plagas, y que afecten la normal producción de Caña de Azúcar. Por este motivo y dada la importancia que tiene este tema para nuestro país, se efectuó esta investigación, cuyos objetivos fueron los siguientes: 19 Determinar la reacción varietal de 100 variedades del Banco de Germoplasma de la Caña de Azúcar del CINCAE, a Carbón (Ustilago scitaminea Sydow), Roya (Puccinia melanocephala Sydow) y el virus del Mosaico (Sugarcane Mosaic Virus). Establecer una base de datos con información fitosanitaria que sirva de herramienta en la selección de buenos progenitores que serán utilizados en futuros cruzamientos para el desarrollo de líneas promisorias por parte del CINCAE para los cañicultores de la zona. Prevenir la proliferación de variedades susceptibles a estas enfermedades. Contribuir al mejoramiento de la productividad del cultivo de la Caña de Azúcar en el Ecuador, con la selección de variedades resistentes a Carbón, Roya y el Virus del Mosaico.Entre principales enfermedades de la Caña de Azúcar en nuestro país, están mosaico común (Sugarcane Mosaic Virus), Carbón de la caña de azúcar (Ustilago scitaminea Sydow) y Roya (Puccinia melanocephala Sydow). Estas han causado enormes pérdidas en la producción del cultivo en algunos países como Australia, Venezuela y Cuba, donde han provocado la sustitución total de las variedades existentes. El presente trabajo tuvo como objetivo determinar la reacción de 100 variedades de Caña de Azúcar del Banco de Germoplasma del CINCAE inoculadas con las enfermedades mencionadas anteriormente, con el fin de obtener un banco de información fitosanitaria, que sirva de herramienta en la selección de buenos progenitores para la utilización de cruzamientos y el desarrollo de líneas promisorias por parte del CINCAE. El ensayo se realizó en el Centro de Investigación de la Caña de Azúcar del Ecuador (CINCAE), ubicado en el Km. 49.6 de la vía Durán-El Triunfo, provincia del Guayas; sus coordenadas son 02° 19´ 33´´ de Latitud Sur y 79° 26´ 83´´ de Longitud Oeste, a 45 msnm, temperatura promedio es de 25.5° C, precipitación media anual de 1400 mm y una humedad relativa de 81%. 7 En estos experimentos se empleó el diseño de bloques completos al azar, con 100 variedades y tres repeticiones. Para el análisis e interpretación de los resultados se utilizaron técnicas de estadística descriptiva, que comprendió el uso de histogramas de frecuencias y cuadros. Para la inoculación de estas enfermedades se utilizaron las metodologías empleadas en el CINCAE, y descritas en libros especializados de Fitopatología. Para ello se realizó una inoculación artificial para el “Mosaico y Carbón”; y una inoculación natural para “Roya”. Para este caso las variedades y testigos seleccionados se clasificaron de acuerdo al grado de reacción de cada enfermedad, utilizando la escala propuesta por Hutchinson and Daniels (16) para Mosaico y Carbón; y, la escala propuesta por Purdy and Dean (26) para la Roya. Los resultados permitieron identificar a 51 variedades con resistencia combinada (altamente resistentes) a estas tres enfermedades. En el caso de Carbón se observó que 87 variedades (87%) resultaron altamente resistentes; 7 variedades (7%) fueron catalogadas como muy resistente a moderadamente resistente; 2 (2%), se situaron en una escala intermedia y 4 variedades (4%) resultaron moderadamente susceptible a susceptible. El grado de susceptibilidad del testigo (CP57-603) superó a las variedades que resultaron susceptibles. 8 Respecto a la Roya, 89 variedades (89%) no mostraron síntomas visibles de la enfermedad; una (1%) mostró manchas individuales cloróticas o café rojizo con pústulas sin abrir; 6 (6%) presentaron manchas individuales cloróticas o café rojizo con pústulas abiertas produciendo esporas y 4 (4%) con manchas grandes en las hojas enrojecidas o necróticas, con pústulas produciendo esporas. El testigo susceptible B4362 alcanzó el máximo grado de reacción con pústulas en tejido verde esporulando activamente. En el caso del Virus de Mosaico, 64 variedades (64%) resultaron altamente resistentes; 6 (6%) como muy resistentes; 5 (5%) resistentes; 9 (9%) moderadamente resistentes; 3 (3%) intermedio; 7 (7%) moderadamente susceptibles; 6 (6%) susceptibles y 3 (3%) muy susceptibles, siendo el testigo B74132 altamente susceptible. Estos resultados permiten disponer de una base de datos con información fitosanitaria que servirá de herramienta para la selección de parentales, que serán utilizadas en los programas de mejoramiento; así como, se podrá prevenir la propagación de variedades susceptibles a estas enfermedades
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Reacción de 100 variedades de caña de azúcar (saccharum officinarum) del banco de germoplasma del cincae, al carbón (ustilago scitaminea sydow), roya (Puccinia melanocephala sydow) y mosaico (sugarcane mosaic virus) en la zona del cantón el triunfo
2009Co-Authors: Fiallos Encalada, Freddy Fabian, Quilambaqui Jara MiguelAbstract:El presente trabajo tuvo como objetivo determinar la reacción de 100 variedades de Caña de Azúcar del Banco de Germoplasma del CINCAE inoculadas, al Carbón (Ustilago scitaminea Sydow), Roya (Puccinia melanocephala Sydow) y Mosaico (Sugarcane Mosaic Virus), las cuales son enfermedades que han causado enormes pérdidas en la producción del cultivo. El ensayo se realizó en el Centro de Investigación de la Caña de Azúcar del Ecuador (CINCAE), ubicado en el cantón El Triunfo, provincia del Guayas. Para la inoculación de estas enfermedades se utilizaron las metodologías empleadas en el CINCAE, y descritas en libros especializados de Fitopatología. Para este caso las variedades se clasificaron de acuerdo al grado de reacción de cada enfermedad, utilizando la escala propuesta por Hutchinson and Daniels para Mosaico y Carbón; y, la escala propuesta por Purdy and Dean para la Roya. Los resultados identificaron a 86, 89 y 64 variedades con niveles de alta resistencia a Carbón, Roya y Mosaico respectivamente. Esto nos permite disponer de una base de datos con información fitosanitaria que servirá de herramienta para el programa de mejoramiento; así como, se podrá prevenir la propagación de variedades susceptibles a estas enfermedades
Y. Rousselle - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Marqueurs moléculaires utilisables en sélection chez la canne à sucre : cas de la résistance à la rouille brune.
2012Co-Authors: Laurent Costet, S. Royaert, L. Toubi, H. Telismart, Y. Rousselle, Louis-marie Raboin, Loïc Le Cunff, Olivier Garsmeur, Catherine Hervouet, J. PauquetAbstract:Les cultivars modernes de canne à sucre (Saccharum spp., 2n=100 à 130) sont hautement polyploïdes, aneuploïdes et d'origine interspécifique. Un gène majeur (Bru1) conférant la résistance à la rouille brune, causée par le champignon Puccinia melanocephala, a été identifié chez le cultivar R570. Nous avons analysé 380 cultivars modernes et clones en cours de sélection, représentatifs de la diversité mondiale, à l’aide de 22 marqueurs moléculaires regroupés dans un segment de 8,2cM génétiquement lié à Bru1 chez R570. Nos résultats révèlent un fort déséquilibre de liaison dans la région autour de Bru1 et de fortes associations entre la plupart des marqueurs et la résistance à la rouille. Deux marqueurs PCR flanquant le segment portant Bru1 sont complètement associés et sont présents uniquement chez les clones résistants. Ces marqueurs constituent des marqueurs moléculaires diagnostics de Bru1. 86% des 194 clones de canne à sucre résistants possèdent les marqueurs diagnostics de Bru1, révélant que ce gène constitue la principale source de résistance à la rouille brune chez les cultivars modernes. Les marqueurs PCR diagnostics de Bru1 devraient être particulièrement utiles pour identifier des cultivars possédant des sources de résistance alternatives à Bru1 afin de diversifier la base génétique de la résistance à la rouille brune dans les programmes de sélection.
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Haplotype structure around Bru1 reveals a narrow genetic basis for brown rust resistance in modern sugarcane cultivars
Theoretical and Applied Genetics, 2012Co-Authors: L. Costet, L. Cunff, S. Royaert, L.-m. Raboin, C. Hervouet, L. Toubi, H. Telismart, O. Garsmeur, Y. Rousselle, J. PauquetAbstract:Modern sugarcane cultivars ( Saccharum spp., 2 n = 100–130) are high polyploid, aneuploid and of interspecific origin. A major gene ( Bru 1) conferring resistance to brown rust, caused by the fungus Puccinia melanocephala, has been identified in cultivar R570. We analyzed 380 modern cultivars and breeding materials covering the worldwide diversity with 22 molecular markers genetically linked to Bru 1 in R570 within a 8.2 cM segment. Our results revealed a strong LD in the Bru 1 region and strong associations between most of the markers and rust resistance. Two PCR markers, that flank the Bru 1-bearing segment, were found completely associated with one another and only in resistant clones representing efficient molecular diagnostic for Bru 1. On this basis, Bru 1 was inferred in 86 % of the 194 resistant sugarcane accessions, revealing that it constitutes the main source of brown rust resistance in modern cultivars. Bru 1 PCR diagnostic markers should be particularly useful to identify cultivars with potentially alternative sources of resistance to diversify the basis of brown rust resistance in breeding programs.
L. Toubi - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Marqueurs moléculaires utilisables en sélection chez la canne à sucre : cas de la résistance à la rouille brune.
2012Co-Authors: Laurent Costet, S. Royaert, L. Toubi, H. Telismart, Y. Rousselle, Louis-marie Raboin, Loïc Le Cunff, Olivier Garsmeur, Catherine Hervouet, J. PauquetAbstract:Les cultivars modernes de canne à sucre (Saccharum spp., 2n=100 à 130) sont hautement polyploïdes, aneuploïdes et d'origine interspécifique. Un gène majeur (Bru1) conférant la résistance à la rouille brune, causée par le champignon Puccinia melanocephala, a été identifié chez le cultivar R570. Nous avons analysé 380 cultivars modernes et clones en cours de sélection, représentatifs de la diversité mondiale, à l’aide de 22 marqueurs moléculaires regroupés dans un segment de 8,2cM génétiquement lié à Bru1 chez R570. Nos résultats révèlent un fort déséquilibre de liaison dans la région autour de Bru1 et de fortes associations entre la plupart des marqueurs et la résistance à la rouille. Deux marqueurs PCR flanquant le segment portant Bru1 sont complètement associés et sont présents uniquement chez les clones résistants. Ces marqueurs constituent des marqueurs moléculaires diagnostics de Bru1. 86% des 194 clones de canne à sucre résistants possèdent les marqueurs diagnostics de Bru1, révélant que ce gène constitue la principale source de résistance à la rouille brune chez les cultivars modernes. Les marqueurs PCR diagnostics de Bru1 devraient être particulièrement utiles pour identifier des cultivars possédant des sources de résistance alternatives à Bru1 afin de diversifier la base génétique de la résistance à la rouille brune dans les programmes de sélection.
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Haplotype structure around Bru1 reveals a narrow genetic basis for brown rust resistance in modern sugarcane cultivars
Theoretical and Applied Genetics, 2012Co-Authors: L. Costet, L. Cunff, S. Royaert, L.-m. Raboin, C. Hervouet, L. Toubi, H. Telismart, O. Garsmeur, Y. Rousselle, J. PauquetAbstract:Modern sugarcane cultivars ( Saccharum spp., 2 n = 100–130) are high polyploid, aneuploid and of interspecific origin. A major gene ( Bru 1) conferring resistance to brown rust, caused by the fungus Puccinia melanocephala, has been identified in cultivar R570. We analyzed 380 modern cultivars and breeding materials covering the worldwide diversity with 22 molecular markers genetically linked to Bru 1 in R570 within a 8.2 cM segment. Our results revealed a strong LD in the Bru 1 region and strong associations between most of the markers and rust resistance. Two PCR markers, that flank the Bru 1-bearing segment, were found completely associated with one another and only in resistant clones representing efficient molecular diagnostic for Bru 1. On this basis, Bru 1 was inferred in 86 % of the 194 resistant sugarcane accessions, revealing that it constitutes the main source of brown rust resistance in modern cultivars. Bru 1 PCR diagnostic markers should be particularly useful to identify cultivars with potentially alternative sources of resistance to diversify the basis of brown rust resistance in breeding programs.
S. Royaert - One of the best experts on this subject based on the ideXlab platform.
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Marqueurs moléculaires utilisables en sélection chez la canne à sucre : cas de la résistance à la rouille brune.
2012Co-Authors: Laurent Costet, S. Royaert, L. Toubi, H. Telismart, Y. Rousselle, Louis-marie Raboin, Loïc Le Cunff, Olivier Garsmeur, Catherine Hervouet, J. PauquetAbstract:Les cultivars modernes de canne à sucre (Saccharum spp., 2n=100 à 130) sont hautement polyploïdes, aneuploïdes et d'origine interspécifique. Un gène majeur (Bru1) conférant la résistance à la rouille brune, causée par le champignon Puccinia melanocephala, a été identifié chez le cultivar R570. Nous avons analysé 380 cultivars modernes et clones en cours de sélection, représentatifs de la diversité mondiale, à l’aide de 22 marqueurs moléculaires regroupés dans un segment de 8,2cM génétiquement lié à Bru1 chez R570. Nos résultats révèlent un fort déséquilibre de liaison dans la région autour de Bru1 et de fortes associations entre la plupart des marqueurs et la résistance à la rouille. Deux marqueurs PCR flanquant le segment portant Bru1 sont complètement associés et sont présents uniquement chez les clones résistants. Ces marqueurs constituent des marqueurs moléculaires diagnostics de Bru1. 86% des 194 clones de canne à sucre résistants possèdent les marqueurs diagnostics de Bru1, révélant que ce gène constitue la principale source de résistance à la rouille brune chez les cultivars modernes. Les marqueurs PCR diagnostics de Bru1 devraient être particulièrement utiles pour identifier des cultivars possédant des sources de résistance alternatives à Bru1 afin de diversifier la base génétique de la résistance à la rouille brune dans les programmes de sélection.
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Haplotype structure around Bru1 reveals a narrow genetic basis for brown rust resistance in modern sugarcane cultivars
Theoretical and Applied Genetics, 2012Co-Authors: L. Costet, L. Cunff, S. Royaert, L.-m. Raboin, C. Hervouet, L. Toubi, H. Telismart, O. Garsmeur, Y. Rousselle, J. PauquetAbstract:Modern sugarcane cultivars ( Saccharum spp., 2 n = 100–130) are high polyploid, aneuploid and of interspecific origin. A major gene ( Bru 1) conferring resistance to brown rust, caused by the fungus Puccinia melanocephala, has been identified in cultivar R570. We analyzed 380 modern cultivars and breeding materials covering the worldwide diversity with 22 molecular markers genetically linked to Bru 1 in R570 within a 8.2 cM segment. Our results revealed a strong LD in the Bru 1 region and strong associations between most of the markers and rust resistance. Two PCR markers, that flank the Bru 1-bearing segment, were found completely associated with one another and only in resistant clones representing efficient molecular diagnostic for Bru 1. On this basis, Bru 1 was inferred in 86 % of the 194 resistant sugarcane accessions, revealing that it constitutes the main source of brown rust resistance in modern cultivars. Bru 1 PCR diagnostic markers should be particularly useful to identify cultivars with potentially alternative sources of resistance to diversify the basis of brown rust resistance in breeding programs.
